Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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BNIP3Q12983 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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BNIP3Q12983 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BNIP3Q12983 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BNIP3Q12983 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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