Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms