Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms