Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms