Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB4P54760 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms