Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZEB1P37275 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZEB1P37275 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms