Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC8P31273 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms