Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms