Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms