Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms