Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPCAMP16422 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPCAMP16422 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms