Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms