Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PAPLNO95428 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms