Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms