Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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