Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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RAB18Q9NP72 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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RAB18Q9NP72 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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RAB18Q9NP72 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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RAB18Q9NP72 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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RAB18Q9NP72 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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RAB18Q9NP72 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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RAB18Q9NP72 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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