Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SGCZQ96LD1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SGCZQ96LD1 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SGCZQ96LD1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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