Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms