Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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UBXN4Q92575 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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