Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4AQ8WYN0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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