Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYBPQ8N488 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms