Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms