Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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