Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PHYHD1Q5SRE7 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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