Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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RPE65Q16518 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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RPE65Q16518 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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RPE65Q16518 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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