Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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