Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCOA1Q15788 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA1Q15788 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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