Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms