Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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