Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms