Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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