Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP3Q12983 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms