Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBRQ0VD83 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms