Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TLE4Q04727 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms