Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RPS29P62273 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RPS29P62273 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RPS29P62273 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms