Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LMO4P61968 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms