Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SPCS3P61009 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SPCS3P61009 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SPCS3P61009 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SPCS3P61009 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SPCS3P61009 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SPCS3P61009 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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