Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms