Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms