Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX1P48742 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms