Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AC093642.2-201ENST00000625132 4805 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 RD3-201ENST00000367002 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 FMO3-201ENST00000367755 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ACTN1-201ENST00000193403 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ZNF587-201ENST00000339656 6882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ZNF544-208ENST00000596825 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 WDR47-202ENST00000361054 4115 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 MAP3K13-209ENST00000443863 3025 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CX3CL1-201ENST00000006053 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 RASGRP4-219ENST00000618320 3313 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AC022107.1-201ENST00000624833 3094 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PKNOX2-201ENST00000298282 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PPARGC1B-204ENST00000403750 3146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SMARCAD1-204ENST00000457823 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ATP2B2-204ENST00000397077 8964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AP000552.1-201ENST00000447720 3215 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SEC31B-201ENST00000370345 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 GIMAP4-201ENST00000255945 2060 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 BDNF-201ENST00000314915 4340 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 COL4A5-201ENST00000328300 6483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 COL4A5-202ENST00000361603 6469 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SLC7A6OS-201ENST00000263997 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 UBE2L5P-203ENST00000638137 2176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 R3HDM2-205ENST00000403821 3347 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SLC6A12-203ENST00000424061 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LINC00933-201ENST00000557887 2606 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ACAN-208ENST00000561243 7593 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 COL25A1-209ENST00000622134 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TRIM62-201ENST00000291416 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 C10orf67-201ENST00000323327 2799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PCID2-204ENST00000375459 1668 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ZNF185-210ENST00000454925 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 MEIS1-212ENST00000495021 2836 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 FAM71F1-201ENST00000315184 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 MRPS14-202ENST00000476371 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LIMK1-202ENST00000418310 3360 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TCF21-201ENST00000237316 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 BRF2-201ENST00000220659 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ATP13A1-201ENST00000291503 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 C4orf50-201ENST00000324058 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 DRGX-201ENST00000374139 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 BCAS3-217ENST00000588462 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms