Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms