Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms