Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms