Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDSP20132 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDSP20132 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms