Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNT1P13805 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms