Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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