Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms