Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP2AO43633 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms