Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms